شهدت محافظة البحيرة حالة من الجدل الشديد خلال الفترة الاخيرة بعد انتشار ظاهرة بناء المساجد بمدن وقرى المحافظة الممولة من قبل شخصيات ورجال اعمال قطريين وكذلك قرار مديرية الاوقاف تغيير اسماء تلك المساجد إلى أسماء اخرى.
قررت مديرية الأوقاف بالبحيرة تغيير أسماء عدد من المساجد بالمحافظة، والتى أنشئت بتمويل من شخصيات قطرية وتحمل أسماءهم.